1、二氧化碳培養箱的加熱方式有兩種，水套式和氣套式。水是很好的絕熱物質，水套式培養箱在開門過程中溫度下降速度慢，能很好的保持培養箱的溫度，但是缺點就是需要加水，清空水箱和清洗。氣套式培養箱是由加熱器直接加熱，操作比水套式的培養箱簡單。但是散熱很快，開門時間長溫度就會下降很多。現在市場上多為氣套式培養箱。
2、一般的細胞培養都要求37度，5%二氧化碳的濃度，這種條件對霉菌生長也是很有效的。保持培養箱無菌至關重要，如果你的培養箱不是在層流實驗室里放著的就經常會在鐵盤上長菌，清潔起來也很麻煩，尤其是培養箱利用率很高的情況下。現在多數采用往增濕盤中添加飽和硫酸銅的方法處理，這種方法還是比較有效的，但是如果對環境有要求不能放的時候，就要經常換增濕盤的水。我的建議是每兩周更換一次。有些培養箱中增加了照射增濕盤的紫外燈管，我覺得毫無用處，時間長還是會長菌。還有些培養箱有過濾器，一般都在培養箱頂端，這種裝置比紫外的效果要好，也可以參考使用。盡量在拿取放置培養皿培養瓶的時候用酒精消毒手。
3、二氧化碳濃度對整個培養環境的影響也是很大，一般的濃度檢測系統都是紅外傳導，但是這類產品在使用一段時間后都會產生二氧化碳數值漂移，盡量選用帶紅外校正的培養箱。如果是老式的，有一種可以在你關閉二氧化碳后也可以顯示二氧化碳值的機器，這類培養箱在清潔過后，先不通二氧化碳，恒溫恒濕放置一夜后把顯示出來的二氧化碳值調整為零，就完成了校準。如果沒有顯示的機器也需要不通二氧化碳放置4小時以上，因為紅外傳導的探測器是在37度，大于95%濕度的狀態下才能準確的工作，如果操作不當會引起二氧化碳濃度發生偏移。也可以請專業人士定期對二氧化碳培養箱進行校準